Bilim İnsanları, Atık Suda COVID-19 Varyantları Bulunabileceğini Söyledi


SARS-CoV-2 kanıtlarının ortaya çıktığı tek yer PCR ve hızlı testler değildir. COVID-19’a neden olan virüs aynı zamanda bir şehrin atık suyunda da ortaya çıkıyor ve bu, salgın sırasında bilim adamlarına enfeksiyonların zirve yaptığı yerlere erken bir bakış sağlamak için güçlü bir araç haline geldi. Atık su analizi, hastaneler ve diğer sağlık tesisleri semptomlarda ve pozitif testlerde artış olduğunu fark etmeden birkaç gün önce sağlık görevlilerini enfeksiyondaki artışlar konusunda uyarır.

Şimdi bilim adamları, virüsün varlığına veya yokluğuna ek olarak, SARS-CoV-2’nin belirli varyantlarını tanımlayabilen atık suyu analiz etmek için daha kesin bir yol geliştirdiler. Bu, halk sağlığı uzmanlarının daha fazla sayıda COVID-19 vakasına hazırlanmalarına ve nihayetinde topluluklara risk hakkında daha iyi tavsiyelerde bulunmanın yanı sıra hazır testler ve gerekirse yeni tedavi yanıtları, virüsün farklı sürümleriyle yüzleşmek için yardımcı olabilir.

İçinde yayınlanan makale Doğa 7 Temmuz’da, San Diego’daki California Üniversitesi’ndeki Mikrobiyom İnovasyon Merkezi direktörü Rob Knight ve ekibi, Scripps Research’teki bilim adamları ile birlikte, varyantların genetik imzalarını seçmek ve nispi oranı belirlemek için bir sistem geliştirdi. Test ettikleri atık su numunelerindeki bu varyant suşların. Yalnızca SARS-CoV-2’yi değil, aynı zamanda sayısız başka bakteri, virüs ve patojeni de içeren atık su numunelerinde varyantları belirlemek zor olmuştur. Toplama alanlarındaki (belediye atık arıtma tesisleri gibi) atık su, belirli bir bölgedeki milyonlarca insanın atık sularını içerdiğinden, viral konsantrasyonlar da oldukça seyreltiktir.

Bilim adamları, SARS-CoV-2 varyantlarını doğru bir şekilde belirleme şanslarını artırmak için 360 binayı kapsayan 131 bölgeden UC San Diego kampüsünde günlük olarak toplanan yaklaşık 20.000 örneğe odaklandı. Pozitif örneklerde buldukları SARS-CoV-2 virüsünün bir alt kümesini genetik olarak dizilediler ve bu dizileri kampüsteki kliniklerden alınan pozitif COVID-19 testleriyle karşılaştırdılar. Ayrıca bu dizileri San Diego’daki test alanlarından toplananlarla ve San Diego County’den gelen atık su örnekleriyle karşılaştırdılar.

Bu analizler, araştırmacıların sadece birkaç kaşık atık su ile kampüste yaşayan 10.000 öğrenci ve okulda zaman geçiren 25.000 kişi arasındaki COVID-19 enfeksiyonlarının ne zaman artış eğiliminde olduğunu belirlemesine olanak sağladı – kampüste yapılan testlerin belgelenmesinden 14 gün öncesine kadar . Ekip, pozitif örneklerin nereden toplandığını bildiğinden, binaya kadar enfeksiyonların yayıldığı yeri de belirleyebildiler. Okul yetkilileri virüsün yayılmasını sınırlamak için test ve izolasyon politikalarını artırabildiklerinden, atık su gözetiminden gelen bu tür önceden uyarı, üniversite kampüsü gibi bir ortamda salgınların kontrol altına alınmasında yardımcı olur.

Araştırmacılar, varyantları tespit etmeye yönelik yeni sistemleriyle, kampüs kliniklerinden yapılan pozitif PCR testlerinin dizilenmesinden daha geniş bir yelpazede SARS-CoV-2 suşlarını atık sudan alabileceklerini ve çeşitliliğin daha doğru bir resmini sunabileceklerini keşfettiler. üniversite kampüsü gibi bir toplulukta dolaşan suşlar. Onların aracı, esasen, belirli varyantlara özgü genetik bir mutasyon barkodu yarattı; bu, bilim adamlarının, daha sonra, bir atık su örneğindeki virüsün ne kadarının, farklı varyantlar için belirli barkodlar içerdiğini belirlemesine izin verdi. Kasım 2020’den Eylül 2021’e kadar örnekler topladılar ve o sırada dolaşan Alpha, Delta ve Epsilon dahil olmak üzere ana varyantların oranlarını tespit edip belirleyebildiler.

Ekip, 2021’in sonlarında ABD’de yayılmaya başlayan Omicron’u izlemek için Şubat 2022’ye kadar veri topladı ve örneklerinde Delta’nın Omicron ile hızlı bir şekilde değiştirildiğini belgeledi. UC San Diego kampüsünün yakınındaki Point Loma atık su arıtma tesisinden alınan örneklerle çalışarak, 27 Kasım’da Omicron’u da tespit edebildiler; Omicron’un okul kampüsündeki testlerden ilk klinik tanımlaması 10 gün sonra, 8 Aralık’ta geldi.

Atık su gözetiminin gücü halk sağlığı görevlileri üzerinde kaybolmadı. ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri, bir Ulusal Atıksu Gözetim Programı Ülke genelinde atık sudaki virüs yüklerini izleyen ve bu verileri halka sağlayan 2020’de. Sağlık görevlilerini vakalardaki ani artışlar ve testlerden daha hızlı yeni varyantların ortaya çıkması konusunda uyarmanın yanı sıra, atık evrensel olduğu için atık su, belirli bir toplulukta virüs düzeylerinin tarafsız bir ölçüsü olma avantajına da sahiptir. Testler, insanlar semptomlar hissettiğinde test edilen veya sağlık sistemlerine erişen popülasyonlara dayalı önyargıları yansıtabilir. Test ayrıca bazı enfeksiyonları da gözden kaçırır, çünkü enfekte olan ancak semptom geliştirmeyen bazı kişiler genellikle test yaptırmazlar.

Yazarlar bulgularını açıklarken şöyle yazıyorlar: “Atık su, belirli viral soyların yaygınlığını tahmin etmek için bilgi açısından yoğun bir kaynaktır ve yalnızca genel enfeksiyon dinamiklerinin değil, aynı zamanda belirli endişe türlerinin yükselişi ve düşüşü hakkında topluluk çapında bir anlık görüntü sağlar.” “SARS-CoV-2 gelişmeye devam ettikçe, endişe verici yeni varyantların riski yüksek olmaya devam ediyor…[and] Yerel virüs dinamiklerini anlamamızda ‘kör noktaların’ ortadan kaldırılması için uygun maliyetli, önyargıları azaltan ve enfeksiyon göstergelerini takip etmek yerine öncü sağlayan teknolojilerin geliştirilmesi esastır.”

TIME’dan Daha Fazla Okunması Gereken Hikaye


Bize Ulaşın [email protected] adresinde.


Kaynak : https://time.com/6194539/wastewater-covid-19-variants/

SMM Panel PDF Kitap indir